Molekuláris genetikai markerek jellemző bizonyos típusú molekuláris genetikai markerek
Molekuláris genetikai markerek
A molekuláris genetikai marker - egy komplex rendszer által képviselt két tényező. Az első közülük - egy egyedi nukleotid-szekvenciát, amely lehetővé teszi, hogy pontosan feltérképezzük a kívánt kromoszómán. A második tényező - a jelenléte a közelben egy előre meghatározott részének a kromoszóma elemet vagy intra (vagy inter) a polimorfizmus.
Genetikai polimorfizmus - változást a nukleotid-szekvencia a DNS-marker, által okozott különböző típusú mutációk (pontmutációk, inszerciók, deléciók és vagy bármely más kromoszóma rekonstrukció). Kifejezési formák genetikai polimorfizmusok allél nevezzük. A polimorf jellege az adott lókusz növeli a allélek száma. A jelen két vagy több allél előfeltétele a használata lokusz mint lehetséges genetikai marker.
Az egyik fontos feltétele a molekuláris genetikai markerek tenyész a kívánt jellemzők és tulajdonságok ismerete a genetikai tulajdonság alapú. Szükség van azokban az esetekben, amikor mi érdekli egy jel nem határozható meg egyetlen gén, gén-csoport. Ugyanakkor, ha ezek a gének nem szorosan genetikai kapcsolatban állnak egymással, használva az egyiket a molekuláris genetikai marker nagyon nehézzé válik. Ugyanakkor köztudott, hogy az ilyen mennyiségi gének gyakran társulnak az úgynevezett „mennyiségi tulajdonság lókusz» (QTL), és együtt öröklődnek, lehetővé téve a molekuláris genetikai markerek.
Jellemzői bizonyos típusú genetikai markerek
Single nukleotid helyettesítéseket vagy SNP (az angol egypontos nukleotid polimorfizmus). SNP dot nukleotid helyettesítéseket (mutációk) a leggyakoribb típus a polimorf markerek és képviselik a helyettesítését, egy nukleotid egy másik. Előfordulási - egy az ezer bázispár, és azok a tehenek teljes számának a genomban eléri a hárommillió (néhány tíz millió). Érték és triallelnyh biallelikus egypontos nukleotid szubsztitúciók nagyban felé tolódott biallelikus mivel Százalék trialelnyh frakció egytizede százalék. Ezért SNP markerek alacsony szintű polimorfizmust és a nagy evolúciós konzervativizmus.
- szinonimája - nem tehető egy helyettesítő aminosav-összetételét a kódolt fehérje
- nonsynonymous - megváltoztatják az aminosavszekvenciát összetételét a kódolt fehérjék.
Egységes nukleotid szubsztitúciók megváltoztathatják a a promoter aktivitását, befolyásolja a konformációját DNS és a pre-mRNS, szintjének meghatározása a géntranszkripció és a hatékonyság a splicing.
A tandem ismétlődéseket - a megismétlése egyes szekvenciák orientációjában „fejtől farokig”. Mivel az egyik lókusz ismétli ugyanazt motívumot, a szekvenciákat nevű műholdak.
Tandem ismétlődések váltak az egyik leginkább informatív genetikai markerek haszonállatok, mint a tandem ismétlődések számának különböző állatok műholdak változik.
Maksisatellity - teljes hossza az ismétlődő szekvenciák több, mint 5 bp
Miniszatellit - teljes hossza a fragmensek a több ezer 30 ezer bp Így motívumok hossza terjedő 10-60 bp [Jeffreys 1985].
A mikroszatellitek - a teljes hossza a fragmens általában kisebb, mint 350 bp, és a hossza a motívum jellemzően kettő és hat bp [Tautz 1989]. Mikroszatellit mind átírt és a nem-átíródó DNS-helyek.
A szempontból lehet osztani informatív polimorf markerek biallelikus (egypontos nukleotid szubsztitúciók) és multiallelnye (tandem ismétlődések, és a diszpergált rendszer).
A kutatás során összpontosítson az egypontos nukleotid helyettesítéseket, hiszen ezek közé a genetikai markerek élettartam a szarvasmarha.