Peptidek szerkezetét a
Peptidek szerkezetét a
Általános információk a peptid szerkezetét
Ábra. 4.1 ábra egy tripeptid, amely az aminosavak az alanin, a cisztein és a valin. Megjegyezzük, hogy a tripeptid három maradék, de nem a három peptid kötések.
Ábra. 4.1. A szerkezeti képlet a tripeptid. Peptid kötések vannak árnyékolva az érthetőség kedvéért.
Ez hozott, hogy képviselje a szerkezet a peptid, úgy, hogy az N-terminális maradék (amely szabad aminocsoportot) helyezünk a bal oldalon, és a C-terminális maradék (a szabad a-karboxil-csoport) - a jobb. Egy ilyen peptid csak egy szabad a-amino-csoport, és csak egy a-karboxil-csoport. Ez igaz minden polipeptid, amelynek előállításához csak aminosavak egymáshoz peptidkötésekkel között kialakult az a-amino- és a-karboxil-csoport. Bizonyos peptidek terminális amino-csoport vagy terminális karboxilcsoportot módosítjuk (például szolgálhat egy acil-származékot, vagy egy amid Egy aminocsoport egy karboxilcsoport), és így nem szabad.
Felvételi peptidek szerkezeti képlet
Nézzük rámutatnak a legegyszerűbb módja, hogy rögzítse. Először is, a sorsolás „gerincét” a kapcsolódnak egymáshoz, és az a-szénatom. Ezek a csoportok váltakoznak mentén a gerinc láncban. Ezután csatlakoztassa a a-szénatomjai a megfelelő oldalsó csoportok. Bemutatjuk ezt az eljárást részletesebben.
1. felhívni a cikcakkos vonal a tetszőleges hosszúságú, és adjunk hozzá a bal N-terminális aminosav-csoport:
2. ágyazott-láncban lévő szénatomra, és karboxil és az a-amino-csoport:
3. egyesít megfelelő -csoport (amelyek árnyékolt) és egy-hidrogénatomok, hogy az a-szénatomok:
Ábra. 4.2. Képviselete elsődleges szerkezetének a hexapeptid a hárombetűs és egybetűs megnevezések az aminosavmaradékok. Ez a hexapeptid tartalmaz a N-végén glutamát (Glu. E). és a C-terminális alanin
Az elsődleges szerkezet a peptid
A lineáris szekvenciát aminosavak a polipeptid-lánc az úgynevezett primer peptid szerkezetét. Ahhoz, hogy meghatározzuk a primer szerkezetét a polipeptid, szükséges, hogy állítsa be a számát, kémiai szerkezetét és a sorrendben az összes aminosav összetételét.
A polipeptidek (fehérjék) is tartalmazhat 100 vagy több aminosavat, azonban a hagyományos szerkezeti képletek kényelmetlen, hogy képviselje a primer szerkezetet. „Kémiai cursive” használ vagy hárombetűs vagy egybetűs aminosav jelöléssel, húzott, a táblázat második oszlopában. 3.3 (ábra. 4.2). Amikor elnevezésekor peptidszármazék kezelik a C-terminális aminosavcsoport.
Ha az elsődleges szerkezete egyedülállóan beállítva, a hárombetűs jelöléssel aminosav maradékok csatlakozott gondolatjel. Single-betűs jelzéssel nem csatlakozik kötőjel. Ha egy része a polipeptid-lánc a pontos szekvenciáját aminosavmaradékok nem ismert, ezek az aminosavak van zárójelben, és vesszővel elválasztva (ábra. 4.3).
Ábra. 4.3. Heptapeptid tartalmazó szakasz, a pontos elsődleges szerkezet, amely nincs telepítve.
Élettani változások hatását az elsődleges szerkezet
Cseréje minden egyik aminosav másik a lineáris szekvenciában a 100 vagy több aminosavat vezethet csökkenését vagy teljes elvesztését a biológiai aktivitása a peptid, mivel ez súlyos következményekkel járna (példaként, a sarlósejtes vérszegénység; lásd a 6. fejezetet ..). Sok örökletes anyagcserezavarok okozta pontosan Egyetlen helyettesítések az ilyen típusú. A fejlesztés a hatékony új meghatározására szolgáló módszerek a fehérjék szerkezetében, s a DNS megtanulta a biokémiai alapja számos öröklődő betegségek összefüggő metabolikus rendellenességek.