A transzkripció kezdőpontja - vegyész útmutatója 21
Kémia és vegyi technológia
A represszor három fág promoter aktivitását szabályozza, amelyek közül kettő, Pm és Pp egymás mellett helyezkednek el. Az Rk.c és Rn promoterek transzkripciója ellentétes irányban megy. Ezeknek a promotereknek a kiindulási pontjain belül az Ok kötő represszor három helyszíne van. Or. és Op, (88. ábra). Az Op régió átfedi az RNS polimeráz kötőhelyet a PPM promoterrel. ezért a represszor Oj-hoz való kötődése gátolja az RNS-polimeráz Rk.m-hez való kötődését, ezáltal elnyomja a transzkripciót. [C.145]
A mag különösen a víruspecifikus DNS-függő RNS polimeráz sok tucatnyi molekuláját tartalmazza. Ez a nagy, többkomponensű enzim felismeri a korai gének promoterét. A promoterek erősen gazdagodnak az A-T-pároknál, és a transzkripció kiindulási pontjából mintegy 30 bázispárral távolítják el, és a sejtes RNS polimerázt nem ismerik fel ezek a promoterek. A szabályozóelemeket, mint a vacciniavírus genomjának fokozóit nem írják le. [C.307]
Ezeknek a megfigyeléseknek a legegyszerűbb magyarázata a következő. Az egyszálú DNS esetében az RNS polimeráz a lánc bármely részét alkalmazhatja a transzkripció megkötésére és megkezdésére. Azonban gyakorlatilag nincs affinitása a natív DNS kettős hélix nagy részét illetően. A DNS kettős hélixének néhány kiindulási pontja, az affinitás, amelyhez az RNS polimeráz rendelkezik, az. nyilvánvalóan különleges szakaszok, amelyek egy speciális sorrendben purin és pirimidin bázisok. amely lehetővé teszi a polimeráz számára, hogy kettős hélixet nyisson meg. A spirál megnyitása után az RNS polimeráz a két komplementer lánc egyikéhez csatlakozhat, és a transzkripció sablonjaként kezdi használni. A kiindulási pontnak ez a bázisszekvenciája olyannak kell lennie, hogy a helytelen láncban levő szekvencia ebben a pontban teljesen kizárja annak lehetőségét, hogy RNS-polimerázt használjon ebben a rossz láncban az RNS szintézis megindításához. [C.403]
Miután a transzkripció kezdődött a kiindulási ponton. Az RNS polimeráz tovább halad [c.139]
Hasonló eredményeket érhetünk el az exonukleázzal végzett kísérletek során. Ez az enzim a DNS végső szakaszán hat, és ezt követően lebontja. Ha egy fehérje kötődik a DNS-hez. akkor ütközés esetén a nukleáz hatása megszűnik. Ebben az esetben a promoter határait is meghatározhatjuk, azaz mindkét oldalán elhelyezkedő pontokat, amelyeken túl az exonukleáz nem tud előre haladni. Így. Ismét megerősítettük, hogy az RNS-polimerázhoz kötődő szekvencia körülbelül 44 bázispár méretű. a transzkripció kezdőpontjától balra. [C.143]
Együttesen, ezek az eredmények azt jelzik, hogy az RNS-polimeráz kötődik, és aszimmetrikusan a DNS-résszel mintegy 44-50 n. N. ha a kiindulási ponttól a transzkripció felől számoljuk, és kb. 20p. n-a transzkripció során. Legutóbbi 25-30 n. N. Egy kötőhely található upstream, kevésbé erősen lépni az enzimmel. Ez a régió van társítva egy enzim jól ahhoz, hogy védve van, amikor egy puha feldolgozási endo- vagy exonukleázok, de nem tudnak ellenállni keményebb feldolgozási körülmények eléréséhez alkalmazott teljes fragmenseket kapcsolódó része enzimet. Ezek az adatok jó egyezést mutat a modell, amelyben van egy kötőhely az RNS-polimeráz, ahol (mint látni fogjuk) néhány kapcsolattartási pontok fontosabbak. mint mások. [C.143]
A promóter fő eleme. az RNS polimeráz kötés helyén, amelyet az RNS szintézisének megkezdése előtt elfoglal, A promoter készítmény tartalmazhat továbbá a fehérje szabályozók kötési helyeit is. Az RNS-palI.meráz kötőhely nagysága megegyezik a hossza és kb. 70 bp. Ez a hely a transzkripció során aszimmetrikusan helyezkedik el kiindulási pontjával, határvonala 20 ponttól a kiindulási ponttól. és a fordulóban - körülbelül 50 bp. (pH = 85). [C.140]
A transzkripció kiindulási pontja különböző promóterekben 6-9 bázispár. a Pribnov-sorozattól (85. A kezdeti nukleotid RNS leggyakrabban által diktált az A mátrix vagy Q. Előnyben purinok, azonban nem feltétlenül, és több promoterek, amelyek kodon kezdődik a C, vagy U, jelenléte ellenére a parttól egy vagy két nukleotidját potenciális purin kezdődő. Egyes promoterek kiindulási pont nem szigorúan rögzített iniciációs történik dvuhtreh szomszédos nukleotidot mátrix. [C.141]
A laktóz operonkezelő közvetlenül a transzkripció kezdőpontja mögött helyezkedik el. Hosszú ideig úgy vélték, hogy egy laktóz represszor hozzáadása a prodrughoz szterikusan befolyásolja az RNS polimeráz kötődését. Azonban a közelmúltban bizonyították, hogy a represszor és az RNS polimeráz a promóteren egymás mellé helyezhető. Ezért az elnyomás kifinomultabb mechanizmusaira kell gondolnunk. beleértve a represszor sajátos kapcsolatait RNS polimerázzal. A laktóz-operonban két pszeudo-operátor hasonló a nukleotidszekvenciában az operátorral, de rendelkezik [c.150]
A Pc és Pv0 promoterek transzkripciójának kiindulási pontja 147 bp távolságban van. A Pc represszálásával az AgA-proteint az araOi-operátor köti össze, amely átfedi az RNS-polimeráz-kötőhelyet. Az aktivátor állapotában. Az AgA fehérje kötődik az ara-helyhez. közvetlenül az RNS-poli-meráz és a promóter kötőhelyének szomszédságában. Feltételezhető, hogy az aktiválás az RNS polimerázzal való érintkezés miatt következik be. [C.152]
Az elsődleges transzkriptumok szintézise. Kezdeményezése mindkét osztálya elsődleges transzkripciós szintézis megy végbe szomszédos részeiben a genom - egy olyan területen, amely telített transzkripciós szabályozó elemeket, és magában foglalja op DNS replikációs helyet (ábra. 158). Mindkét osztály A transzkriptumok nem csak szigorúan rögzített kiindulási pont 5, így co-terminális mRNS-molekulák minden osztályon belül valamelyest különböznek hosszúságú (például mikroheterogenitásának különösen erősen kifejezett késői transzkriptumok). Mindazonáltal elmondható, hogy a korai mRNS promoterének [c.300]
Mindezen szabályozási elemek lehetővé teszik a master RNS polimeráz II-nek a korai gének hatékony transzkripcióját a röviddel azután, hogy e vírus DNS-je belépett a sejtmagba. Korai transzkriptumok feldolgozásának eredményeképpen (lásd 302. oldal), a korai fehérjék mRNS-ei alakulnak ki, majd ezeket a fehérjéket. Egyikük - a T-antigén - központi szerepet játszik a vírusgenom transzkripciójának későbbi átszervezésében. Számos hatással jár. Először a virális DNS-helyekkel kölcsönhatásba lép, amelyek a T-antigént (legerőteljesebben a helyszínt és a leggyengébbet a helyszínnel) 11 cm-re kötik (lásd a 158. ábrát). Ennek eredményeként a korai gének transzkripciója gátolt. beleértve a T-antigént kódoló gént is. A T-antigén itt bemutatja a represszor tulajdonságait. amelynek szintézise transzkripciós autogén szabályozásnak van alávetve. A korai gének későbbi szakaszában történő átírása azonban nem teljesen megáll. Ez folytatódik, bár sok. de a transzkripció kiindulópontja észrevehetően eltolódott, úgyhogy a TATA elem már az átírt szekvencián belül van (158. A korai régió késői átírásának mechanizmusa új kiindulási pontról nem olvasható le. [C.301]
A provirus promotor elemei így az u3 régióban helyezkednek el. lehetőségét provírus transzkripciós után történik a megjelenése területek elölről a vírus DNS-genom, t. e. bekövetkezése után LTR. Körülbelül 25 p. a transzkripciós kezdőpont (legfeljebb L) jellegzetes TATA elemet igénypont 75. I.- CAAT-elem és 100-300 n. Navier-Stokes enhancer. Különböző erősvírusoknak különböző erõssége van. és onkogén retrovírusok erejét fokozó összefüggésben lehet azzal a képességgel, a vírus okoz malignus transz (yurmatsiyu célsejtek. aktiválásához a fokozó kell lennie kölcsönhatása celluláris fehérjékkel -regulators bizonyos esetekben, például egér emlőrák-vírus. hatékonyságát fokozó hormonok szabályozzák (révén fehérjék - hormon receptorok) [c.314]
Az állítható bakteriális terminátorokat csillapítók (attenuátorok) nevezik. A triptofán operon, az E. coli csillapítóját először felfedezték és jobban tanulmányozták. Ez az operon öt génből áll, amelyek a triptofán bioszintézis enzimjeit kódolják. A szabályozást két rendszer végzi, amelyek érzékelik a sejt triptofánban való igényét. Az első rendszer befolyásolja az iniciáció hatékonyságát az operon promóterben. A triptofán-operon triptophan-operon és triptofán kombinációja az operátorhoz csatlakozik, a transzkripciós kiindulási pont előtt a -10 tartományban. és sztérikusan megakadályozza, hogy az RNS-polimeráz a promoterhez kapcsolódjon. Így. a triptofán feleslegével az operont elnyomják. Triptofán hiányában a represszor elveszíti kommunikációs képességét az operátorral, amelynek következtében az operon indukálódik. Ezt a rendszert 180 bp távolságban elosztott csillapítón keresztül egészíti ki. a transzkripciós start pont belső oldalon található, ahol a kifejezés transzkripciós start pontot említeni. [C.149] [c.152] [c.158] [c.301] [c.149] [c.152] [c.301] [c.308] [c.404] [c.491] [C.21] [c.140] [c.140] [c.141] [c.143] Genes (1987) - [c.139. c.140]